主要有两种情况：
(1)可查到的教育、卫生等行业企业，属于新设立企业，适用注册资本500万元以下这一标准被判定入库。
举例说明：山东A教育培训有限公司设立于2018年6月，注册资本300万元，山东B教育培训公司设立于2020年8月，注册资本300万元，二者均属教育行业企业。A设立时间早(已公示2019年度年报),经判定，因属于教育行业，不符合市场监管总局判定标准，未纳入小微企业库；B属于新设立企业(按规定自2021年开始公示年报),适用注册资本500万元以下这一标准，就会产生A不入库，B入库现象。
(2)有的企业只是名称相似，实际上登记机关认定所属行业类别不同，也会造成有的企业入库，有的不入库。
举例说明：山东A教育咨询有限公司(登记机关认定行业为商务服务业),山东B教育咨询有限公司(登记机关认定行业为教育业),二者名称相似，行业类别不同，就会产生A入库，B不入库的现象。此种情况，建议申请人向企业登记机关确认行业类别。